Missionen blandt Hjemløses arbejde ledes af bestyrelser.
Mændenes Hjem og Kollegiet Gl. Køge Landevej er selvejende institutioner med egne bestyrelser.
Missionen blandt Hjemløses væresteder og opsøgende arbejde har en fælles styregruppe, mens Værestedet i Sydvest ledes og administreres af støtteforeningen Værestedets Venners bestyrelse.
Missionen blandt Hjemløses bestyrelse
Hanne Thomsen (formand)
Benny Flindt (næstformand)
Anna Flyverbom
Kirsten Fog Hjort
Anja Holgård
Svend Åge Hjelm
Sekretariatsleder.
Administrativ medarbejder: Helene L. Nielsen
Mændenes Hjems bestyrelse
Jens Møller Johansen (formand)
Niels Andersen (næstformand)
Hanne Thomsen
Ivan Christensen
Kirsten Fog Hjorth
Forstander: Robert Olsen
Kollegiet GL. Køge Landevejs bestyrelse
Lars Jensen (formand)
John Christensen (næstformand)
Niels Nymann Eriksen
Bente Sørensen
Lucinda Ellis
Forstander: Nikolaj Olsen
Væresteder og Opsøgende arbejdes styregruppe
Benny Flindt
Anna Flyverbom
Svend Åge Hjelm
Leder for Væresteder og Opsøgende arbejde: Anders Sørensen
Værestedsleder for Amadeus og Pegasus: Jørgen Hansen
Bestyrelse for Støtteforeningen Værestedet i Sydvests Venner
Anders Sørensen, Missionen blandt Hjemløse (formand)
Thomas Nedergaard
Helle Jeppesen
Kjeld Bødker
Jan Jørgensen, brugerrepræsentant